Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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TrabdQ99JY4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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TrabdQ99JY4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrabdQ99JY4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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