Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

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Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Smc6Q924W5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smc6Q924W5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smc6Q924W5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smc6Q924W5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smc6Q924W5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Smc6Q924W5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Smc6Q924W5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smc6Q924W5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smc6Q924W5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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