Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn1Q922Y1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn1Q922Y1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn1Q922Y1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubxn1Q922Y1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ubxn1Q922Y1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ubxn1Q922Y1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ubxn1Q922Y1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn1Q922Y1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms