Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Med28Q920D3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms