Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ppargc1bQ8VHJ7 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms