Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q8VDP2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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