Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD62

Bles03, UPF0696 protein C11orf68 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bles03Q8VD62 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Bles03Q8VD62 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Bles03Q8VD62 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms