Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SgtbQ8VD33 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms