Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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