Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ldQ8VCH2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ldQ8VCH2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ldQ8VCH2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ldQ8VCH2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ldQ8VCH2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ldQ8VCH2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd300ldQ8VCH2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd300ldQ8VCH2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms