Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnf183Q8QZS5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms