Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb12Q8K4N3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms