Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx52Q8K301 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms