Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Fbxo18Q8K2I9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Fbxo18Q8K2I9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Fbxo18Q8K2I9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Fbxo18Q8K2I9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Fbxo18Q8K2I9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fbxo18Q8K2I9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms