Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scara5Q8K299 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scara5Q8K299 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Scara5Q8K299 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scara5Q8K299 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scara5Q8K299 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scara5Q8K299 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scara5Q8K299 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Scara5Q8K299 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Scara5Q8K299 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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