Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkn3Q8K045 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms