Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LgsnQ8CIX8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LgsnQ8CIX8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms