Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ercc8Q8CFD5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ercc8Q8CFD5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ercc8Q8CFD5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Ercc8Q8CFD5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Ercc8Q8CFD5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ercc8Q8CFD5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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