Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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9030612E09RikQ8CE20 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
9030612E09RikQ8CE20 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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