Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8C708 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8C708 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q8C708 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms