Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp20Q8C6M1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp20Q8C6M1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp20Q8C6M1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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