Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Col6a6Q8C6K9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col6a6Q8C6K9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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