Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ssuh2Q8C3L1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ssuh2Q8C3L1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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