Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TtpaQ8BWP5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TtpaQ8BWP5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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