Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp38Q8BW70 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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