Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nup54Q8BTS4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup54Q8BTS4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms