Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fbxo38Q8BMI0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fbxo38Q8BMI0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fbxo38Q8BMI0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fbxo38Q8BMI0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fbxo38Q8BMI0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fbxo38Q8BMI0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fbxo38Q8BMI0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Fbxo38Q8BMI0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fbxo38Q8BMI0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms