Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU0

Sgta, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtaQ8BJU0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SgtaQ8BJU0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SgtaQ8BJU0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms