Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4dQ8BGV9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4dQ8BGV9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Atg4dQ8BGV9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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