Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trim6Q8BGE7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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