Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Smim19Q80ZU4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms