Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms