Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc27Q80YS5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lrrc27Q80YS5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Lrrc27Q80YS5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Lrrc27Q80YS5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Lrrc27Q80YS5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Lrrc27Q80YS5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Lrrc27Q80YS5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Lrrc27Q80YS5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc27Q80YS5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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