Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Usp8Q80U87 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Usp8Q80U87 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Usp8Q80U87 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Usp8Q80U87 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Usp8Q80U87 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Usp8Q80U87 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp8Q80U87 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Usp8Q80U87 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Usp8Q80U87 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Usp8Q80U87 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp8Q80U87 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp8Q80U87 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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