Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrc2bQ7TPM1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms