Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ScocQ78YZ6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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