Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rph3alQ768S4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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