Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Znf653Q6YND2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Znf653Q6YND2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.4 ms