Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssx9Q6XAS3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssx9Q6XAS3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ssx9Q6XAS3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ssx9Q6XAS3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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