Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Cxcl3Q6W5C0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Cxcl3Q6W5C0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Cxcl3Q6W5C0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cxcl3Q6W5C0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cxcl3Q6W5C0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cxcl3Q6W5C0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Cxcl3Q6W5C0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cxcl3Q6W5C0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms