Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Atp8b3Q6UQ17 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atp8b3Q6UQ17 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Atp8b3Q6UQ17 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Atp8b3Q6UQ17 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Atp8b3Q6UQ17 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Atp8b3Q6UQ17 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Atp8b3Q6UQ17 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms