Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rad54bQ6PFE3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad54bQ6PFE3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad54bQ6PFE3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rad54bQ6PFE3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms