Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HltfQ6PCN7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HltfQ6PCN7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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