Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Herc4Q6PAV2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Herc4Q6PAV2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms