Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Usp49Q6P9L4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp49Q6P9L4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Usp49Q6P9L4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms