Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ8

Gm5414, MCG1050941, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5414Q6IFZ8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5414Q6IFZ8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5414Q6IFZ8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms