Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Krt39Q6IFX4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Krt39Q6IFX4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms