Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Krt40Q6IFX3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Krt40Q6IFX3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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