Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt42Q6IFX2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt42Q6IFX2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt42Q6IFX2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt42Q6IFX2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt42Q6IFX2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt42Q6IFX2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt42Q6IFX2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt42Q6IFX2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt42Q6IFX2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms