Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf280dQ68FE8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms